Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
LAMA3Q16787 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
LAMA3Q16787 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
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