Protein–RNA interactions for Protein: Q16777

HIST2H2AC, Histone H2A type 2-C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2ACQ16777 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
HIST2H2ACQ16777 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
HIST2H2ACQ16777 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms