Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PDK4Q16654 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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