Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
NTRK2Q16620 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
NTRK2Q16620 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms