Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CTF1Q16619 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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CTF1Q16619 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CTF1Q16619 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
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CTF1Q16619 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CTF1Q16619 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CTF1Q16619 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
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