Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

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Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGCAQ16586 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SGCAQ16586 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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