Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SGCBQ16585 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms