Protein–RNA interactions for Protein: Q16363

LAMA4, Laminin subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,823 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA4Q16363 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
LAMA4Q16363 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
LAMA4Q16363 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
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