Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NTRK3Q16288 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NTRK3Q16288 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
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