Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 CERS4-205ENST00000558331 1803 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CCDC6Q16204 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CCDC6Q16204 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms