Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ATP6AP1Q15904 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ATP6AP1Q15904 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms