Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ALX1Q15699 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ALX1Q15699 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
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