Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.7
TRIP10Q15642 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
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TRIP10Q15642 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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TRIP10Q15642 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
TRIP10Q15642 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
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