Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
SIX1Q15475 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
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SIX1Q15475 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SIX1Q15475 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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