Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CYTH1Q15438 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CYTH1Q15438 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms