Protein–RNA interactions for Protein: Q15417

CNN3, Calponin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3Q15417 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNN3Q15417 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CNN3Q15417 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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