Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
PRKD1Q15139 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRKD1Q15139 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
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PRKD1Q15139 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRKD1Q15139 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRKD1Q15139 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
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PRKD1Q15139 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
PRKD1Q15139 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
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