Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PSME4Q14997 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PSME4Q14997 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME4Q14997 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME4Q14997 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PSME4Q14997 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms