Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
COL19A1Q14993 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
COL19A1Q14993 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
COL19A1Q14993 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
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COL19A1Q14993 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
COL19A1Q14993 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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COL19A1Q14993 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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COL19A1Q14993 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
COL19A1Q14993 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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