Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SEMA3AQ14563 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SEMA3AQ14563 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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