Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
RBM39Q14498 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RBM39Q14498 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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