Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CNGB1Q14028 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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CNGB1Q14028 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNGB1Q14028 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
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