Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CACNA1CQ13936 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CACNA1CQ13936 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
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