Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
KLF9Q13886 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
KLF9Q13886 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms