Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
EXOSC2Q13868 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms