Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PDE3BQ13370 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PDE3BQ13370 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
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