Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3B2Q13367 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
AP3B2Q13367 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
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