Protein–RNA interactions for Protein: Q13296

SCGB2A2, Mammaglobin-A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB2A2Q13296 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SCGB2A2Q13296 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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SCGB2A2Q13296 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
SCGB2A2Q13296 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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