Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLN3Q13286 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLN3Q13286 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
CLN3Q13286 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CLN3Q13286 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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