Protein–RNA interactions for Protein: Q13278

RIG, Putative protein RIG, humanhuman

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Length 110 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIGQ13278 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RIGQ13278 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RIGQ13278 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RIGQ13278 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RIGQ13278 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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