Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
SRSF6Q13247 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SRSF6Q13247 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
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