Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
CSTF3Q12996 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
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