Protein–RNA interactions for Protein: Q12981

BNIP1, Vesicle transport protein SEC20, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP1Q12981 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
BNIP1Q12981 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
BNIP1Q12981 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms