Protein–RNA interactions for Protein: Q12398

HMS1, Probable transcription factor HMS1, yeastyeast

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Length 434 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
HMS1Q12398 ALK2YBL009W 2031 nt1.91□□□□□ -2.1
HMS1Q12398 SCH9YHR205W 2475 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 NEO1YIL048W 3456 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YDL025W-AYDL025W-A 105 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 TEN1YLR010C 483 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YEL043WYEL043W 2871 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RNH70YGR276C 1662 nt1.9□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SSD1YDR293C 3753 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MUD2YKL074C 1584 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 PSK2YOL045W 3306 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BNA7YDR428C 786 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BI2Q0110 1272 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 AIM29YKR074W 468 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RPL37AYLR185W 267 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SEN15YMR059W 387 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 TOM22YNL131W 459 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MGM1YOR211C 2646 nt1.89□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SEC16YPL085W 6588 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SHE9YDR393W 1371 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 VPS52YDR484W 1926 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 AGC1YPR021C 2709 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YDL068WYDL068W 330 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YBL108WYBL108W 306 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YOR248WYOR248W 303 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RSA1YPL193W 1146 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RPB5YBR154C 648 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 VPS35YJL154C 2835 nt1.88□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SSY1YDR160W 2559 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YCR001WYCR001W 315 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YDL041WYDL041W 354 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SMB1YER029C 591 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YER188C-AYER188C-A 300 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YGL014C-AYGL014C-A 162 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 VOA1YGR106C 798 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BIG1YHR101C 1008 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 tT(UGU)Q1tT(UGU)Q1 76 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SNC1YAL030W 354 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MSL5YLR116W 1431 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SYM1YLR251W 594 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 VTI1YMR197C 654 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YOR032W-AYOR032W-A 201 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 PTC5YOR090C 1719 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SPC29YPL124W 762 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RRP6YOR001W 2202 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 NCL1YBL024W 2055 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BAS1YKR099W 2436 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MET18YIL128W 3099 nt1.87□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 NUP100YKL068W 2880 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 LRE1YCL051W 1752 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YHR130CYHR130C 336 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YLR171WYLR171W 390 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RUF22RUF22 515 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 DGR1YNL130C-A 147 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MF(ALPHA)1YPL187W 498 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YBR076C-AYBR076C-A 267 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YMR045CYMR045C 5268 nt1.86□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BRE1YDL074C 2103 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 CDC24YAL041W 2565 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 DIS3YOL021C 3006 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RVS161YCR009C 798 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 HUR1YGL168W 333 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RPI1YIL119C 1224 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YML108WYML108W 318 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 COX7YMR256C 183 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RTC6YPL183W-A 282 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 KOG1YHR186C 4674 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 GIP3YPL137C 3831 nt1.85□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 STB4YMR019W 2850 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 CDC53YDL132W 2448 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 FMP16YDR070C 282 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YER135CYER135C 393 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 BRP1YGL007W 378 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YJR157WYJR157W 363 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 YLR269CYLR269C 351 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 RPS22BYLR367W 393 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 SIP18YMR175W 240 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 NOP15YNL110C 663 nt1.84□□□□□ -2.11
HMS1Q12398 MGA2YIR033W 3342 nt1.84□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YJL016WYJL016W 1686 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 PUT3YKL015W 2940 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YHR139C-AYHR139C-A 312 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YKL111CYKL111C 336 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 SLM6YBR266C 453 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 UFD4YKL010C 4452 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 GIS1YDR096W 2685 nt1.83□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 HOP2YGL033W 657 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YGR025WYGR025W 303 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 MSL1YIR009W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 SEC22YLR268W 645 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 CMC2YBL059C-A 330 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YPR039WYPR039W 336 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 TAE2YPL009C 3117 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YBR012W-AYBR012W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YOR142W-AYOR142W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YPR158W-AYPR158W-A 1323 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 IRC10YOL015W 1761 nt1.82□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 HMLALPHA2YCL067C 633 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 MATALPHA2YCR039C 633 nt1.81□□□□□ -2.12
HMS1Q12398 YDL118WYDL118W 381 nt1.81□□□□□ -2.12
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