Protein–RNA interactions for Protein: Q12303

YPS3, Aspartic proteinase yapsin-3, yeastyeast

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YPS3Q12303 YOR192C-CYOR192C-C 237 nt1.86□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 ARR2YPR200C 393 nt1.86□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 VMA9YCL005W-A 222 nt1.86□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 SAP185YJL098W 3177 nt1.86□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 DAS1YJL149W 1992 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 SAP190YKR028W 3102 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 YJL181WYJL181W 1836 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 UBC7YMR022W 498 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 UTP13YLR222C 2454 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 TFC3YAL001C 3483 nt1.85□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 CBF2YGR140W 2871 nt1.84□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 PAU8YAL068C 363 nt1.84□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 YLR434CYLR434C 384 nt1.84□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 PAU20YOL161C 363 nt1.84□□□□□ -2.11
YPS3Q12303 INP53YOR109W 3324 nt1.84□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 STH1YIL126W 4080 nt1.84□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPR089WYPR089W 2667 nt1.84□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PRP6YBR055C 2700 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SNF12YNR023W 1701 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SDC1YDR469W 528 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RAD6YGL058W 519 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YJL052C-AYJL052C-A 120 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YJR011CYJR011C 786 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 HIT1YJR055W 495 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPL185WYPL185W 396 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 TRM7YBR061C 933 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 snR43snR43 209 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 NUP170YBL079W 4509 nt1.83□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RAV1YJR033C 4074 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 NUP100YKL068W 2880 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PSO2YMR137C 1986 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YCR081C-AYCR081C-A 237 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YGL165CYGL165C 579 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RPS20YHL015W 366 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 AYR1YIL124W 894 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 UTP30YKR060W 825 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 BSC3YLR465C 309 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPL039WYPL039W 951 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPR197CYPR197C 564 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 VPS16YPL045W 2397 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 NAB6YML117W 3405 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 MSL5YLR116W 1431 nt1.82□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SCP160YJL080C 3669 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YEL043WYEL043W 2871 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 REV3YPL167C 4515 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 MCD1YDL003W 1701 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 snR70snR70 164 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SDH7YDR511W 402 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 URA10YMR271C 684 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 ZEO1YOL109W 342 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPL080CYPL080C 327 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 TSC3YBR058C-A 243 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPL197CYPL197C 414 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YBR197CYBR197C 654 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 UBR1YGR184C 5853 nt1.81□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 CLN3YAL040C 1743 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 GIS1YDR096W 2685 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 BRE1YDL074C 2103 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YER137W-AYER137W-A 306 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RPL29YFR032C-A 180 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YGR025WYGR025W 303 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 UBP2YOR124C 3819 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPL225WYPL225W 441 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YBR277CYBR277C 402 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SNU114YKL173W 3027 nt1.8□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RGA1YOR127W 3024 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 IRC4YDR540C 540 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YEL018C-AYEL018C-A 534 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PAU14YIL176C 363 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PEP8YJL053W 1140 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PAU1YJL223C 363 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YLR154W-AYLR154W-A 186 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 SIP18YMR175W 240 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 DGR1YNL130C-A 147 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YNL146WYNL146W 303 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 ERP4YOR016C 624 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 snR13snR13 124 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 USO1YDL058W 5373 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YNL034WYNL034W 1839 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YJR098CYJR098C 1971 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 DPB11YJL090C 2295 nt1.79□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 YPR097WYPR097W 3222 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RTT102YGR275W 474 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RPC10YHR143W-A 213 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 RPS24BYIL069C 408 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 DGK1YOR311C 873 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 FKS1YLR342W 5631 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 APL5YPL195W 2799 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 PRK1YIL095W 2433 nt1.78□□□□□ -2.12
YPS3Q12303 GIP3YPL137C 3831 nt1.78□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 UTP22YGR090W 3714 nt1.78□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 RRP12YPL012W 3687 nt1.78□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 UBR2YLR024C 5619 nt1.77□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 RPL27BYDR471W 411 nt1.77□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 YJR023CYJR023C 402 nt1.77□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 RPS17AYML024W 411 nt1.77□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 RPS7BYNL096C 573 nt1.77□□□□□ -2.13
YPS3Q12303 RPB11YOL005C 363 nt1.77□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 15 ms