Protein–RNA interactions for Protein: Q12229

UBX3, UBX domain-containing protein 3, yeastyeast

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Length 455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
UBX3Q12229 PFF1YBR074W 2931 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ISW1YBR245C 3390 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 STE5YDR103W 2754 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SIP3YNL257C 3690 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SRO77YBL106C 3033 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 GCN4YEL009C 846 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YER023C-AYER023C-A 213 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YFR056CYFR056C 369 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YHR032W-AYHR032W-A 180 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SHE2YKL130C 741 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YMR290W-AYMR290W-A 348 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YMR320WYMR320W 306 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PGA1YNL158W 597 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ESF2YNR054C 951 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 MMS1YPR164W 4224 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 BNR1YIL159W 4128 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PUF4YGL014W 2667 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 NPR3YHL023C 3441 nt2.52□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 AMS1YGL156W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 TCB2YNL087W 3537 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 HOP2YGL033W 657 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YHR086W-AYHR086W-A 162 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 NCE101YJL205C 162 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RPO41YFL036W 4056 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RTT10YPL183C 3042 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SDC25YLL016W 3147 nt2.51□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YKU80YMR106C 1890 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 TPS2YDR074W 2691 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YER189WYER189W 369 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YHL006W-AYHL006W-A 354 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 MCM22YJR135C 720 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YLR031WYLR031W 561 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RPL26AYLR344W 384 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RPS29AYLR388W 171 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 IRC23YOR044W 474 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PDR1YGL013C 3207 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SMY2YBR172C 2223 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 CYR1YJL005W 6081 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 FAR11YNL127W 2862 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 KEL2YGR238C 2649 nt2.5□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 GIN4YDR507C 3429 nt2.49□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 WIP1YDR374W-A 270 nt2.49□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YBL073WYBL073W 312 nt2.49□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YOR055WYOR055W 435 nt2.49□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SWA2YDR320C 2007 nt2.49□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 VPS52YDR484W 1926 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ARP8YOR141C 2646 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YBP1YBR216C 2025 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SSY1YDR160W 2559 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR250CYDR250C 276 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YHR063W-AYHR063W-A 336 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YIL058WYIL058W 285 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 NUP82YJL061W 2142 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR098C-BYDR098C-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR210C-DYDR210C-D 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR316W-BYDR316W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR365W-BYDR365W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YER138CYER138C 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YER160CYER160C 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YGR038C-BYGR038C-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YGR161C-DYGR161C-D 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YJR027WYJR027W 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YLR157C-BYLR157C-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YML039WYML039W 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YML045WYML045W 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YMR050CYMR050C 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YOL103W-BYOL103W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YBR012W-BYBR012W-B 5271 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YOR142W-BYOR142W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YPL257W-BYPL257W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YPR158W-BYPR158W-B 5271 nt2.48□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 NPR1YNL183C 2373 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 FKS3YMR306W 5358 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 BAS1YKR099W 2436 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RPL39YJL189W 156 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ISF1YMR081C 1017 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 RPL9BYNL067W 576 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YOR050CYOR050C 348 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ACM1YPL267W 630 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YDR239CYDR239C 2364 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ECM5YMR176W 4236 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PCF11YDR228C 1881 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ORC2YBR060C 1863 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 YPK1YKL126W 2043 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 ESL2YKR096W 3588 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PTP3YER075C 2787 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 PSK2YOL045W 3306 nt2.47□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 MRD1YPR112C 2664 nt2.46□□□□□ -2.01
UBX3Q12229 SRB8YCR081W 4284 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YDR209CYDR209C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YGR050CYGR050C 357 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 PEX4YGR133W 552 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YAL042C-AYAL042C-A 378 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 RGM1YMR182C 636 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YPL229WYPL229W 621 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YJL181WYJL181W 1836 nt2.46□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YJL016WYJL016W 1686 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 YDL041WYDL041W 354 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 ADK1YDR226W 669 nt2.45□□□□□ -2.02
UBX3Q12229 RPS17BYDR447C 411 nt2.45□□□□□ -2.02
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