Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
LOXL1Q08397 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
LOXL1Q08397 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms