Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNB2Q08289 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB2Q08289 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms