Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ARHGAP1Q07960 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms