Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SOX4Q06945 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SOX4Q06945 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms