Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
LTBQ06643 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBQ06643 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LTBQ06643 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LTBQ06643 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms