Protein–RNA interactions for Protein: Q06148

NEJ1, Non-homologous end-joining protein 1, yeastyeast

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NEJ1Q06148 TUS1YLR425W 3924 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YER038W-AYER038W-A 381 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SMD1YGR074W 441 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YIL102CYIL102C 306 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 TPM2YIL138C 486 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 ARV1YLR242C 966 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YOR364WYOR364W 369 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 ATP20YPR020W 348 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SPO24YPR036W-A 204 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SYH1YPL105C 2550 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YFL002W-BYFL002W-B 1317 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YGR161W-AYGR161W-A 1317 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YBL100W-AYBL100W-A 1317 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YCL020WYCL020W 1317 nt1.37□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 MON2YNL297C 4911 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YDR194W-AYDR194W-A 153 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 CAJ1YER048C 1176 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YHR054CYHR054C 1065 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 COA6YMR244C-A 315 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YOR105WYOR105W 327 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YOR394C-AYOR394C-A 168 nt1.36□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 FYV8YGR196C 2454 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SPC72YAL047C 1869 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 POL5YEL055C 3069 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 BRR2YER172C 6492 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RBK1YCR036W 1002 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YDL062WYDL062W 426 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YIL030W-AYIL030W-A 339 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 GRX8YLR364W 330 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SPC29YPL124W 762 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YPL238CYPL238C 390 nt1.35□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 snR9snR9 187 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SNO3YFL060C 669 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 YGR228WYGR228W 345 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RPI1YIL119C 1224 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 TEN1YLR010C 483 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 RPS7BYNL096C 573 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 SNO2YNL334C 669 nt1.34□□□□□ -2.19
NEJ1Q06148 TRM3YDL112W 4311 nt1.34□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 NAM7YMR080C 2916 nt1.34□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SAC3YDR159W 3906 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YCR087C-AYCR087C-A 462 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 GPM2YDL021W 936 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YDR286CYDR286C 345 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 MZM1YDR493W 372 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 LAG1YHL003C 1236 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 ECM9YKR004C 1134 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YMR013C-AYMR013C-A 150 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YPL080CYPL080C 327 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 DPB11YJL090C 2295 nt1.33□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 PET309YLR067C 2898 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 RPL31AYDL075W 342 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 BNA7YDR428C 786 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 BET4YJL031C 984 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 HSK3YKL138C-A 210 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YNL010WYNL010W 726 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YPL039WYPL039W 951 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 CSM4YPL200W 471 nt1.32□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 GNT1YOR320C 1476 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 HKR1YDR420W 5409 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 BTT1YDR252W 450 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YFR009W-AYFR009W-A 258 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 TIM8YJR135W-A 264 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 URA10YMR271C 684 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 PHO80YOL001W 882 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 CRM1YGR218W 3255 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SPE1YKL184W 1401 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 MAD1YGL086W 2250 nt1.31□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 NUP192YJL039C 5052 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 STB4YMR019W 2850 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SPC98YNL126W 2541 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 CAT8YMR280C 4302 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YDL041WYDL041W 354 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YJR087WYJR087W 351 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YHC1YLR298C 696 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YBL029C-AYBL029C-A 285 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 RTC6YPL183W-A 282 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YPR096CYPR096C 303 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YPR172WYPR172W 603 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SEC21YNL287W 2808 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 TBS1YBR150C 3285 nt1.3□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 PLC1YPL268W 2610 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 TMA20YER007C-A 546 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 VOA1YGR106C 798 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 RNR4YGR180C 1038 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 PFD1YJL179W 330 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YLR255CYLR255C 354 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 ROX1YPR065W 1107 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YDR210W-AYDR210W-A 1317 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YOR343W-AYOR343W-A 1317 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 KCS1YDR017C 3153 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 REF2YDR195W 1602 nt1.29□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 NUP82YJL061W 2142 nt1.28□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SFB2YNL049C 2631 nt1.28□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YDR042CYDR042C 603 nt1.28□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YFL012WYFL012W 447 nt1.28□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 YGL024WYGL024W 336 nt1.28□□□□□ -2.2
NEJ1Q06148 SCEIQ0160 708 nt1.28□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 29.3 ms