Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DEUP1Q05D60 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.27■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
DEUP1Q05D60 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 428.8 ms