Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNEQ04844 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNEQ04844 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms