Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CREMQ03060 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CREMQ03060 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
CREMQ03060 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CREMQ03060 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms