Protein–RNA interactions for Protein: Q02887

ATG21, Autophagy-related protein 21, yeastyeast

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG21Q02887 YER121WYER121W 345 nt2.54□□□□□ -2
ATG21Q02887 YFR056CYFR056C 369 nt2.54□□□□□ -2
ATG21Q02887 GRX8YLR364W 330 nt2.54□□□□□ -2
ATG21Q02887 MRPL33YMR286W 261 nt2.54□□□□□ -2
ATG21Q02887 YPP1YGR198W 2454 nt2.54□□□□□ -2
ATG21Q02887 INP53YOR109W 3324 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 GCD6YDR211W 2139 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 RTT102YGR275W 474 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 YML037CYML037C 1023 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 YNL058CYNL058C 951 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 CBF2YGR140W 2871 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 AMS1YGL156W 3252 nt2.53□□□□□ -2
ATG21Q02887 YPL216WYPL216W 3309 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 LSO2YGR169C-A 279 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YNL010WYNL010W 726 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YBL071CYBL071C 309 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 RTC6YPL183W-A 282 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YBR277CYBR277C 402 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 VPS64YDR200C 1815 nt2.52□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 FMP16YDR070C 282 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YER137W-AYER137W-A 306 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 SMD1YGR074W 441 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YBR085C-AYBR085C-A 258 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 HSC82YMR186W 2118 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 HOS4YIL112W 3252 nt2.51□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 SDC1YDR469W 528 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 FCF2YLR051C 654 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YOR121CYOR121C 306 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 RPL33AYPL143W 324 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 MSS11YMR164C 2277 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 SNU114YKL173W 3027 nt2.5□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 RRP12YPL012W 3687 nt2.49□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 NOP10YHR072W-A 177 nt2.49□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 RSE1YML049C 4086 nt2.49□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 VPS35YJL154C 2835 nt2.49□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 BFA1YJR053W 1725 nt2.48□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YBL005W-BYBL005W-B 5268 nt2.48□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 MSL5YLR116W 1431 nt2.48□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YEL043WYEL043W 2871 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 KAR3YPR141C 2190 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 RPS20YHL015W 366 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 PAU14YIL176C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 PAU1YJL223C 363 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YPR146CYPR146C 330 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YPR197CYPR197C 564 nt2.47□□□□□ -2.01
ATG21Q02887 YDR209CYDR209C 414 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 PNC1YGL037C 651 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YGR035CYGR035C 351 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YJR011CYJR011C 786 nt2.46□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YNL018CYNL018C 1839 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 ISW1YBR245C 3390 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 BUB1YGR188C 3066 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)G1tW(CCA)G1 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)G2tW(CCA)G2 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)JtW(CCA)J 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)KtW(CCA)K 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)MtW(CCA)M 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 tW(CCA)PtW(CCA)P 72 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 DNA2YHR164C 4569 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TOP2YNL088W 4287 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 CSF1YLR087C 8877 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 CAF120YNL278W 3183 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 SAP1YER047C 2694 nt2.45□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 FAR11YNL127W 2862 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YPL150WYPL150W 2706 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YLR278CYLR278C 4026 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 GIS1YDR096W 2685 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 snR70snR70 164 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YKR033CYKR033C 426 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 UTP30YKR060W 825 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 RPS29AYLR388W 171 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YOL159C-AYOL159C-A 273 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YGR067CYGR067C 2415 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TRA1YHR099W 11235 nt2.44□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YJR098CYJR098C 1971 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 MMS22YLR320W 4365 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 OSW7YFR039C 1533 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TAE2YPL009C 3117 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TRS130YMR218C 3309 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TCB2YNL087W 3537 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 QCR7YDR529C 384 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YGL024WYGL024W 336 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 TWF1YGR080W 999 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YBR121C-AYBR121C-A 159 nt2.43□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 CDC20YGL116W 1833 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 WIP1YDR374W-A 270 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 MSL1YIR009W 336 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YAL063C-AYAL063C-A 291 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YML003WYML003W 873 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YML009C-AYML009C-A 327 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YMR320WYMR320W 306 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 SNC2YOR327C 348 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 SPO22YIL073C 2928 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 SGD1YLR336C 2700 nt2.42□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 BNR1YIL159W 4128 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 EMC6YLL014W 327 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 IRA2YOL081W 9240 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 SWA2YDR320C 2007 nt2.41□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YDR186CYDR186C 2634 nt2.4□□□□□ -2.02
ATG21Q02887 YDL011CYDL011C 324 nt2.4□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 31.2 ms