Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.08
TOP2BQ02880 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
TOP2BQ02880 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms