Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
GCNT1Q02742 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
GCNT1Q02742 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms