Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CSNK1A1-209ENST00000606299 1075 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNB1Q02641 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC068620.4-201ENST00000636730 1182 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TRMT13-201ENST00000370139 711 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CACNB1Q02641 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms