Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
DSG1Q02413 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
DSG1Q02413 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms